首先说说二者的联系
二者都是把货物从某一地方发送到目的地，都属于物流活动，运输是包括配送的。
二者的不同有很多具体如下
概念上，配送是在一定区域范围内，根据客户要求，对物品进行拣选、加工、包装、分割、组配等作业，并按时送达指定地点的物流活动。运输把货物从一个点转移动另外一个点的过程。
范围上的不同，运输比配送的范围更大，配送更多指的是在一个城市或城市的某一区域，而运输更多的是在两个城市、省份甚至国家之间。配送好比是外卖服务，运输好比是物流公司。

运输对象的差异。运输多为大批量、远距离的物品，并且途中兼有储存的功能；而配送包括拣选、加工、包装、组配、运输等多个环节，通常是小批量、多种类的产品运送。
实现方式的不同，运输更多是把一批物品从一个地方转移动另一个地方的过程，而配送更多讲的是服务，要把货物保质、保量、按时送到用户手中的同时还要有额外的服务。
价格的差异：运输是大批量物品的空间转移，整体价格要高，而配送则是小批量甚至单间物品的配送外加一些客户要求的服务内容，整体价格要低。
运用领域的不同：运输更多用于工业领域，而配送则更多是用于普通消费者的个人领域。